厦门高崎国际机场厦门高崎国际机场于１９８３年建成通航。机场的年旅客吞吐能力上升至２７００万人次，是中国东南沿海重要区域性航空枢纽，为中国十二大干线机场之一。厦门高崎国际机场拥有Ｔ３、Ｔ４两座候机楼，已形成覆盖中国大陆各主要城市及港、澳、台地区，连接东南亚、东北亚，通达欧、美、澳三大洲的航线网络。

福州长乐国际机场福州长乐国际机场于１９９７年６月２３日正式通航。２０１８年１１月第二轮扩能航站楼扩建工程竣工，机场年旅客吞吐能力上升至１４００万人次，是中国华东地区重要的航空国际口岸之一，中国东南沿海繁忙机场之一。福州长乐国际机场与境内外９７个城市的１０１座机场通航，已开通航线１３３条。

武夷山机场武夷山机场于１９９４年１月１５日正式开通民航业务，是福建省第三个开通民航运营的机场。２０１７年９月２９日，国际航站区启用。是国内运营情况较好的支线机场之一。武夷山机场可满足年旅客吞吐量２６０万人次的使用需求。

龙岩冠豸山机场元翔龙岩机场坐落在闽西革命老区连城县境内。２００４年４月２５日正式通航，成为华东地区第３６个民用运输机场，标志着闽西与外界有了便携的空中桥梁。作为闽西革命老区的机场，元翔龙岩机场通航后就成为党和国家领导人视察福建的第一站。

厦门五通码头五通客运码头为两岸人民往来的黄金航线，大陆官方访问团赴台通道之一。２０１９年全年旅客吞吐量为１８２万人次，客流量占全省对金、马海上客运航线的９０％以上，是打造厦金半小时交通圈和一日生活圈的关键枢纽。２０１９年五通码头三期新候船楼启用，可预留扩展至远期年吞吐旅客５００万人次的空间。